A pocos quilómetros de la costa de Stone Town hay un grupo de pequeñas islas, entre las que se encuentran Prison Island, Snake Island y Grave Island (Chapwani Island). Son lugares de belleza singular. Es posible visitarlas en excursiones de un día.

La isla de Prison, quizás la más conocida, está habitada por una comunidad de tortugas gigantes y, en el pasado, fue el centro de cuarentena de Zanzíbar.

La isla de Pemba, cuyo sobrenombre es ``Isla Siempreverde´´ debido a su vegetación exuberante. Es famosa por sus mareas espectaculares y por su rica y variadísima vida marina.

En el pueblo y la playa de Kizimkazi, se puede contratar una excursión en barco para divisar delfines, e incluso nadar con ellos. Otra playa ideal para el buceo y la pesca es la de Nungwi, situada al norte de la isla, y dónde se puede ver cómo se construyen las embarcaciones tradicionales dhow, y descubrir la forma tradicional de cultivar algas.

En la Reserva Forestal de Jozani, entre palmeras y laureles se puede divisar algún colobo en su habitat natural, un simio de cola larga.